益生菌通常建議在飯后服用，主要影響因素有胃酸濃度、食物緩沖作用、菌株存活率、個體胃腸功能差異。

空腹時胃酸分泌較多，可能降低益生菌活性，飯后胃酸被食物稀釋，更有利于活菌通過胃部到達腸道。

食物可中和部分胃酸，為益生菌提供保護屏障，尤其含脂肪食物能延長胃排空時間，增加益生菌存活概率。

部分耐酸菌株可飯前服用，但多數(shù)常規(guī)益生菌如雙歧桿菌、乳酸桿菌等對酸敏感，更適合餐后補充。

胃腸敏感者飯后服用可減少刺激，消化功能較弱者可將服用時間調整為餐中或餐后半小時內。

選擇益生菌制劑時可關注標注的菌株特性，服用期間避免與高溫飲品同服，持續(xù)使用兩周以上效果更顯著。